En el artículo “Metagenomic analysis
of microbial communities yields insight into impacts of nanoparticle design”
publicado en la revista Nature Nanotechnology(15 de enero 2018) P. J. Vikesland y colaboradores, del Institute
for Critical Technology and Applied Science (ICTAS), Virginia Tech, USA, presentan una forma de investigar el efecto de las nanopartículas en un microbioma
particular: mirando el ADN de una comunidad microbiana entera en lugar de
especies individuales. La
estrategia, denominada análisis metagenómico, secuencia el ADN de todos los
microbios simultáneamente en una muestra, produciendo una visión general de los
genes funcionales en ese entorno. En el estudio analizaron las comunidades microbianas de lodo activado utilizado en las plantas industriales para descomponer los
contaminantes de las aguas residuales. Estas comunidades comprenden una
cantidad asombrosa de microorganismos, muchos de los cuales no se pueden
cultivar en el laboratorio, e incluso si se pudiera, las complejas interacciones
en las comunidades microbianas en el mundo real no pueden reproducirse mediante
experimentos con unas pocas especies. Las nanopartículas usadas en la investigación fueron esferas y varillas de oro las cuales se introdujeron en las plantas
de tratamiento de las aguas residuales.
Crédito:(ICTAS), Virginia Tech, USA |
Luego han realizado un análisis metagenómico a los 7 días y otro a los 56 días. Resultó que las nanopartículas modificaron
la distribución de genes en la comunidad microbiana del lodo activado. Las nanopartículas esféricas tuvieron una mayor influencia que las nanobarras. Entre
los genes afectados se han encontrado aquellos que ayudan a las bacterias
infecciosas a evadir los antibióticos. Los resultados sugieren que el análisis
metagenómico es una herramienta suficientemente sensible como para detectar
cambios que otros métodos podrían pasar por alto y por ende para el diseño más
seguro de los nanomateriales y de su implicancia en la salud pública.
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