Neuronas programables.

Los científicos de IBM Research crearon el chip cerebro similar más avanzado que se conozca. El chip, denominado TrueNorth, consta de 1 millón de neuronas y 256 millones de sinapsis programables a través de 4.096 núcleos neurosinápticos individuales. Construido  por el  proceso Samsung 28nm (nanómetros) y con la integración de una  cifra record de 5400 millones de transistores, constituye un punto de inflexión en la cognotecnología. TrueNorth es increíblemente eficiente, consume sólo 63 miliwatts a carga máxima, lo que equivale a alrededor de 400 mil millones de operaciones sinápticas por segundo por watt, aproximadamente 176.000 veces más eficiente que los utilizados en una CPU moderna para ejecutar la misma carga de trabajo y 769 veces más eficiente que otros enfoques similares. Este nuevo chip es una versión de segunda generación del prototipo del 2011, sobre la base de un nuevo proceso (Samsung 28nm en vez de IBM de 45nm) y es en varios órdenes de magnitud más complejo, funcional y eficiente. TrueNorth se construye con los transistores CMOS estándar, al igual que la CPU de una PC,  pero ahí terminan las similitudes. Los 4.096 núcleos neurosinápticos de TrueNorth  están dispuestos en una cuadrícula de 64 × 64. Cada núcleo es auto-contenido mediante 256 entradas (axones), 256 salidas (neuronas), un gran banco de SRAM (que almacena los datos para cada neurona) y un router que permite a cualquier neurona  transmitir a cualquier axón hasta 255 núcleos de distancia. La información fluye a través de TrueNorth por medio de espigas neuronales, de los axones a las neuronas, modulados por las sinapsis programables entre ellos. El chip cerebro similar TrueNorth está casi listo para ingresar al mercado de aplicaciones comerciales.  Las redes neuronales son cosas fantásticas, pero históricamente operan en clústeres enormemente ineficientes de ordenadores convencionales. Con la arquitectura verdaderamente  revolucionaria de TrueNorth,  IBM está ahora un paso más cerca de construir un cerebro en un chip, una noticia impactante en el mundo de las tecnologías de convergencia (NBIC) en general y para la cognotecnología en particular.

Lectura complementaria:

A million spiking-neuron integrated circuit with a scalable communication network and interface.

Google ingresa en la era de la secuenciación masiva.

Estamos viviendo un punto de inflexión en la historia en el cual aumenta exponencialmente la posibilidad de recolectar gran cantidad de información acerca de las secuencias del genoma de los individuos, junto con la información clínica necesaria. Mediante la comprensión de la relación entre los genotipos y fenotipos podemos descubrir los mecanismos de la enfermedad, desarrollar diagnósticos - predicciones de riesgo y aumentar el conocimiento para el descubrimiento de nuevos fármacos. Dominar la temática implica manejar un conjunto de datos muy grandes, más grande de lo que cualquier centro de investigación puede recoger por su cuenta. La secuenciación del genoma de una sola persona puede llegar a generar mas de 100 gigabytes de datos en bruto y,  para estudiar los datos de millones de muestras, estos pueden llegar a sumar mas de 100 petabytes, una cifra que requiere de una potencia de calculo realmente inalcanzable para muchos científicos. En tal sentido Google y la Alianza Global para la Genómica y Salud presentaron su primer proyecto conjunto: Google Genomics. El proyecto presenta una nueva API (Application Programming Interface) tendiente a permitir a los investigadores acceder a la potente nube de Google para compartir y procesar la información genómica y clínica (la API es pública de código abierto)...

El proyecto Google Genomics surge en un contexto en el cual Craig Venter acaba de anunciar la creación de una nueva compañía denominada Human Longevity Inc (HLI) cuyo objetivo es secuenciar 40.000 genomas al año para dar soluciones en el área de la salud y el Centro del Genoma de Nueva York anuncia un convenio con IBM para utilizar el poderoso sistema informático Watson en el diagnóstico y la elección de los tratamientos más adecuados para el cáncer.
Cuando el río suena…

Lectura complementaria:

I Simposio Internacional de Secuenciación Masiva del ADN.